Protein–RNA interactions for Protein: P20908

COL5A1, Collagen alpha-1(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1P20908 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL5A1P20908 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL5A1P20908 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL5A1P20908 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms