Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3AP20336 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3AP20336 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms