Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGCP20142 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGCP20142 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGCP20142 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGCP20142 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGCP20142 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGCP20142 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGCP20142 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGCP20142 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGCP20142 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGCP20142 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGCP20142 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGCP20142 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGCP20142 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGCP20142 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGCP20142 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGCP20142 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGCP20142 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGCP20142 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGCP20142 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGCP20142 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGCP20142 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGCP20142 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGCP20142 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGCP20142 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGCP20142 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGCP20142 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGCP20142 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGCP20142 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGCP20142 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGCP20142 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGCP20142 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGCP20142 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGCP20142 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGCP20142 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGCP20142 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGCP20142 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGCP20142 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGCP20142 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGCP20142 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGCP20142 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGCP20142 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGCP20142 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGCP20142 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGCP20142 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGCP20142 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGCP20142 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGCP20142 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGCP20142 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGCP20142 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGCP20142 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGCP20142 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGCP20142 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGCP20142 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGCP20142 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGCP20142 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGCP20142 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGCP20142 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGCP20142 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGCP20142 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGCP20142 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGCP20142 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGCP20142 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGCP20142 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGCP20142 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGCP20142 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGCP20142 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGCP20142 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGCP20142 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGCP20142 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGCP20142 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGCP20142 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGCP20142 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGCP20142 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGCP20142 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGCP20142 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGCP20142 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGCP20142 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGCP20142 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGCP20142 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGCP20142 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGCP20142 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGCP20142 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGCP20142 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGCP20142 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGCP20142 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGCP20142 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGCP20142 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGCP20142 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGCP20142 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGCP20142 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGCP20142 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGCP20142 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGCP20142 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGCP20142 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGCP20142 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGCP20142 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGCP20142 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGCP20142 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGCP20142 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms