Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL2P19875 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL2P19875 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CXCL2P19875 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CXCL2P19875 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CXCL2P19875 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CXCL2P19875 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CXCL2P19875 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CXCL2P19875 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CXCL2P19875 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms