Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
UBTFP17480 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
UBTFP17480 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
UBTFP17480 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
UBTFP17480 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
UBTFP17480 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
UBTFP17480 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
UBTFP17480 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
UBTFP17480 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
UBTFP17480 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
UBTFP17480 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
UBTFP17480 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
UBTFP17480 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
UBTFP17480 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
UBTFP17480 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
UBTFP17480 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
UBTFP17480 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
UBTFP17480 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
UBTFP17480 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
UBTFP17480 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
UBTFP17480 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
UBTFP17480 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
UBTFP17480 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
UBTFP17480 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
UBTFP17480 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
UBTFP17480 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
UBTFP17480 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
UBTFP17480 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
UBTFP17480 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
UBTFP17480 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
UBTFP17480 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
UBTFP17480 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
UBTFP17480 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
UBTFP17480 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
UBTFP17480 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
UBTFP17480 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
UBTFP17480 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
UBTFP17480 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
UBTFP17480 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
UBTFP17480 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
UBTFP17480 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
UBTFP17480 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
UBTFP17480 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
UBTFP17480 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
UBTFP17480 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
UBTFP17480 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
UBTFP17480 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
UBTFP17480 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
UBTFP17480 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
UBTFP17480 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
UBTFP17480 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
UBTFP17480 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
UBTFP17480 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
UBTFP17480 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
UBTFP17480 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
UBTFP17480 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
UBTFP17480 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
UBTFP17480 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
UBTFP17480 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
UBTFP17480 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
UBTFP17480 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
UBTFP17480 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
UBTFP17480 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
UBTFP17480 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
UBTFP17480 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
UBTFP17480 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
UBTFP17480 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
UBTFP17480 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
UBTFP17480 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
UBTFP17480 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
UBTFP17480 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
UBTFP17480 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
UBTFP17480 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
UBTFP17480 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
UBTFP17480 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
UBTFP17480 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
UBTFP17480 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
UBTFP17480 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
UBTFP17480 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
UBTFP17480 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
UBTFP17480 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
UBTFP17480 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
UBTFP17480 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
UBTFP17480 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
UBTFP17480 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
UBTFP17480 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
UBTFP17480 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
UBTFP17480 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
UBTFP17480 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
UBTFP17480 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
UBTFP17480 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
UBTFP17480 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
UBTFP17480 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
UBTFP17480 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
UBTFP17480 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
UBTFP17480 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
UBTFP17480 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
UBTFP17480 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
UBTFP17480 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
UBTFP17480 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms