Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA1P17302 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA1P17302 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA1P17302 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA1P17302 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA1P17302 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA1P17302 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA1P17302 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA1P17302 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA1P17302 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA1P17302 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA1P17302 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA1P17302 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA1P17302 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA1P17302 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA1P17302 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA1P17302 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA1P17302 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA1P17302 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA1P17302 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA1P17302 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA1P17302 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA1P17302 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GJA1P17302 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA1P17302 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA1P17302 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA1P17302 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA1P17302 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA1P17302 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA1P17302 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA1P17302 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA1P17302 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA1P17302 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA1P17302 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA1P17302 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA1P17302 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA1P17302 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA1P17302 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA1P17302 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA1P17302 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA1P17302 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA1P17302 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA1P17302 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA1P17302 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA1P17302 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA1P17302 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA1P17302 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA1P17302 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA1P17302 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA1P17302 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA1P17302 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA1P17302 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA1P17302 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA1P17302 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA1P17302 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA1P17302 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA1P17302 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA1P17302 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA1P17302 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA1P17302 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA1P17302 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA1P17302 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA1P17302 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA1P17302 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA1P17302 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA1P17302 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA1P17302 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA1P17302 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA1P17302 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA1P17302 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA1P17302 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA1P17302 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA1P17302 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA1P17302 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJA1P17302 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA1P17302 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA1P17302 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA1P17302 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms