Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRAP16234 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFRAP16234 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFRAP16234 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDGFRAP16234 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms