Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CSF2RAP15509 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSF2RAP15509 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF2RAP15509 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF2RAP15509 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSF2RAP15509 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSF2RAP15509 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CSF2RAP15509 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSF2RAP15509 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CSF2RAP15509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms