Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GFAPP14136 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFAPP14136 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFAPP14136 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFAPP14136 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFAPP14136 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFAPP14136 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFAPP14136 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFAPP14136 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFAPP14136 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFAPP14136 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFAPP14136 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFAPP14136 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFAPP14136 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFAPP14136 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFAPP14136 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFAPP14136 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFAPP14136 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFAPP14136 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFAPP14136 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFAPP14136 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFAPP14136 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFAPP14136 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFAPP14136 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GFAPP14136 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFAPP14136 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFAPP14136 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFAPP14136 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFAPP14136 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFAPP14136 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFAPP14136 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFAPP14136 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFAPP14136 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFAPP14136 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFAPP14136 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFAPP14136 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFAPP14136 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFAPP14136 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFAPP14136 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFAPP14136 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFAPP14136 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFAPP14136 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFAPP14136 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFAPP14136 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFAPP14136 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFAPP14136 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFAPP14136 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFAPP14136 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFAPP14136 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFAPP14136 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFAPP14136 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFAPP14136 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFAPP14136 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GFAPP14136 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFAPP14136 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFAPP14136 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFAPP14136 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFAPP14136 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFAPP14136 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFAPP14136 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFAPP14136 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GFAPP14136 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFAPP14136 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFAPP14136 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GFAPP14136 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFAPP14136 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFAPP14136 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFAPP14136 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFAPP14136 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFAPP14136 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFAPP14136 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFAPP14136 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFAPP14136 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFAPP14136 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFAPP14136 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFAPP14136 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFAPP14136 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFAPP14136 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFAPP14136 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFAPP14136 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFAPP14136 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFAPP14136 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFAPP14136 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFAPP14136 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFAPP14136 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFAPP14136 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFAPP14136 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFAPP14136 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFAPP14136 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFAPP14136 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFAPP14136 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFAPP14136 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFAPP14136 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms