Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC130P13994 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC130P13994 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC130P13994 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC130P13994 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms