Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-DOBP13765 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DOBP13765 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms