Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL11A1P12107 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL11A1P12107 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL11A1P12107 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL11A1P12107 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL11A1P12107 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms