Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX6A1P12074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COX6A1P12074 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COX6A1P12074 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms