Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2C9P11712 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C9P11712 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C9P11712 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP2C9P11712 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CYP2C9P11712 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYP2C9P11712 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYP2C9P11712 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP2C9P11712 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms