Protein–RNA interactions for Protein: P10155

TROVE2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROVE2P10155 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 216.82■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 216.57■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 516.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 415.46■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 KMT2A-206ENST00000527869 481 ntTSL 315.31■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 KMT2A-211ENST00000533790 804 ntTSL 215.31■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 FSTL4-204ENST00000510685 716 ntTSL 315.18■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 SHC2-206ENST00000590222 951 ntTSL 515.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 314.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 214.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 514.52□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRKCZ-214ENST00000478770 1542 ntTSL 214.39□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 512.5□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 512.33□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 511.92□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-209ENST00000492719 930 ntTSL 311.41□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 510.77□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 510.64□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 29.62□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59.52□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRR7-AS1-203ENST00000511565 502 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.583e-7■■■■■ 28.7
TROVE2P10155 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.721e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.431e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF436-AS1-204ENST00000458053 375 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.75□□□□□ -0.371e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF609-204ENST00000559364 1321 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 ZNF609-203ENST00000558680 418 ntTSL 38.78□□□□□ -11e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.541e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.661e-16■■■■■ 28.6
TROVE2P10155 C10orf90-208ENST00000488181 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.39□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 28.4
TROVE2P10155 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.312e-11■■■■■ 28.3
TROVE2P10155 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 28.2
TROVE2P10155 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.277e-8■■■■■ 28.2
TROVE2P10155 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.874e-52■■■■■ 27.9
TROVE2P10155 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-52■■■■■ 27.9
TROVE2P10155 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.391e-19■■■■■ 27.7
TROVE2P10155 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 27.7
TROVE2P10155 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 27.7
TROVE2P10155 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 27.7
TROVE2P10155 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 27.7
TROVE2P10155 HERC2-207ENST00000564734 3121 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.134e-17■■■■■ 27.6
TROVE2P10155 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.144e-17■■■■■ 27.6
TROVE2P10155 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 27.3
TROVE2P10155 MYO5B-205ENST00000587895 561 ntTSL 411.31□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 27.3
TROVE2P10155 MYO5B-202ENST00000324581 3109 ntTSL 210.07□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 27.3
TROVE2P10155 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.575e-6■■■■■ 27.3
TROVE2P10155 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 27.2
TROVE2P10155 CDHR5-207ENST00000531177 2816 ntTSL 218.5■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 27.2
TROVE2P10155 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 27.2
TROVE2P10155 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 27.2
TROVE2P10155 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 27.2
TROVE2P10155 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 27.2
TROVE2P10155 BAX-207ENST00000502487 1346 ntTSL 1 (best)23.82■■□□□ 1.47e-6■■■■■ 27.1
TROVE2P10155 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.351e-15■■■■■ 27.1
TROVE2P10155 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.231e-15■■■■■ 27.1
TROVE2P10155 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.187e-6■■■■■ 27.1
TROVE2P10155 RUSC1-210ENST00000473331 782 ntTSL 221.17■□□□□ 0.987e-6■■■■■ 27.1
TROVE2P10155 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.981e-15■■■■■ 27.1
TROVE2P10155 RUSC1-215ENST00000492536 1069 ntTSL 320.37■□□□□ 0.857e-6■■■■■ 27.1
TROVE2P10155 SLC2A14-210ENST00000537557 578 ntTSL 319.01■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 27.1
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