Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRBP09619 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRBP09619 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFRBP09619 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDGFRBP09619 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
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