Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA1P09110 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACAA1P09110 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA1P09110 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA1P09110 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA1P09110 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA1P09110 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA1P09110 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA1P09110 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA1P09110 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA1P09110 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA1P09110 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA1P09110 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA1P09110 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA1P09110 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA1P09110 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA1P09110 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA1P09110 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA1P09110 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA1P09110 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA1P09110 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA1P09110 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA1P09110 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACAA1P09110 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACAA1P09110 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACAA1P09110 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms