Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYPP08247 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYPP08247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYPP08247 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYPP08247 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYPP08247 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYPP08247 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYPP08247 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYPP08247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYPP08247 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYPP08247 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYPP08247 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYPP08247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYPP08247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYPP08247 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYPP08247 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYPP08247 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYPP08247 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYPP08247 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYPP08247 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYPP08247 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYPP08247 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYPP08247 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYPP08247 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYPP08247 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYPP08247 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYPP08247 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYPP08247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYPP08247 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYPP08247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPP08247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPP08247 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPP08247 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPP08247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPP08247 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPP08247 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPP08247 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPP08247 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPP08247 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPP08247 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPP08247 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPP08247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPP08247 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPP08247 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPP08247 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPP08247 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPP08247 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPP08247 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPP08247 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPP08247 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPP08247 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPP08247 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPP08247 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPP08247 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPP08247 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPP08247 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPP08247 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPP08247 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPP08247 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPP08247 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPP08247 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPP08247 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPP08247 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPP08247 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPP08247 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPP08247 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPP08247 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPP08247 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPP08247 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPP08247 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPP08247 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPP08247 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPP08247 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPP08247 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPP08247 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPP08247 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPP08247 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPP08247 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPP08247 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPP08247 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPP08247 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPP08247 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPP08247 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPP08247 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPP08247 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPP08247 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPP08247 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPP08247 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPP08247 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPP08247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms