Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEACAM5P06731 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM5P06731 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEACAM5P06731 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM5P06731 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM5P06731 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms