Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT18P05783 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT18P05783 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT18P05783 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT18P05783 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT18P05783 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT18P05783 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT18P05783 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT18P05783 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KRT18P05783 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT18P05783 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT18P05783 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT18P05783 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT18P05783 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT18P05783 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT18P05783 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT18P05783 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT18P05783 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT18P05783 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT18P05783 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT18P05783 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT18P05783 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT18P05783 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT18P05783 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT18P05783 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT18P05783 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT18P05783 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT18P05783 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT18P05783 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT18P05783 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT18P05783 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT18P05783 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT18P05783 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT18P05783 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT18P05783 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT18P05783 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT18P05783 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT18P05783 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT18P05783 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRT18P05783 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRT18P05783 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT18P05783 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT18P05783 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT18P05783 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT18P05783 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT18P05783 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT18P05783 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT18P05783 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT18P05783 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT18P05783 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT18P05783 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT18P05783 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT18P05783 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT18P05783 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT18P05783 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT18P05783 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT18P05783 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT18P05783 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT18P05783 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT18P05783 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT18P05783 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT18P05783 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT18P05783 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT18P05783 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT18P05783 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT18P05783 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT18P05783 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT18P05783 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT18P05783 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT18P05783 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT18P05783 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT18P05783 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT18P05783 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT18P05783 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT18P05783 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT18P05783 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT18P05783 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT18P05783 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT18P05783 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT18P05783 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT18P05783 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT18P05783 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT18P05783 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT18P05783 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT18P05783 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT18P05783 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT18P05783 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT18P05783 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT18P05783 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT18P05783 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT18P05783 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT18P05783 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT18P05783 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms