Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDN1P05305 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDN1P05305 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDN1P05305 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDN1P05305 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EDN1P05305 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
EDN1P05305 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EDN1P05305 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDN1P05305 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EDN1P05305 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDN1P05305 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDN1P05305 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDN1P05305 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDN1P05305 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDN1P05305 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDN1P05305 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDN1P05305 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDN1P05305 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDN1P05305 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDN1P05305 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDN1P05305 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDN1P05305 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDN1P05305 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EDN1P05305 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDN1P05305 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDN1P05305 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDN1P05305 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDN1P05305 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EDN1P05305 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDN1P05305 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDN1P05305 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDN1P05305 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDN1P05305 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EDN1P05305 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EDN1P05305 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EDN1P05305 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDN1P05305 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDN1P05305 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDN1P05305 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDN1P05305 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDN1P05305 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDN1P05305 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDN1P05305 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDN1P05305 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDN1P05305 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDN1P05305 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDN1P05305 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDN1P05305 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDN1P05305 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDN1P05305 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDN1P05305 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDN1P05305 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDN1P05305 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDN1P05305 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDN1P05305 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDN1P05305 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDN1P05305 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDN1P05305 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
EDN1P05305 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
EDN1P05305 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDN1P05305 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EDN1P05305 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EDN1P05305 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDN1P05305 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EDN1P05305 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EDN1P05305 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDN1P05305 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EDN1P05305 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDN1P05305 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
EDN1P05305 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDN1P05305 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EDN1P05305 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDN1P05305 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDN1P05305 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
EDN1P05305 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
EDN1P05305 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDN1P05305 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDN1P05305 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDN1P05305 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDN1P05305 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDN1P05305 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDN1P05305 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDN1P05305 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDN1P05305 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDN1P05305 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDN1P05305 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDN1P05305 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDN1P05305 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDN1P05305 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDN1P05305 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDN1P05305 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDN1P05305 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDN1P05305 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms