Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFIP05156 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFIP05156 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFIP05156 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFIP05156 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFIP05156 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFIP05156 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFIP05156 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFIP05156 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFIP05156 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFIP05156 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFIP05156 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFIP05156 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFIP05156 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFIP05156 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFIP05156 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFIP05156 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFIP05156 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFIP05156 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFIP05156 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFIP05156 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFIP05156 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFIP05156 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFIP05156 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFIP05156 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFIP05156 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFIP05156 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFIP05156 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFIP05156 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CFIP05156 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFIP05156 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFIP05156 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFIP05156 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFIP05156 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFIP05156 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CFIP05156 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFIP05156 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFIP05156 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFIP05156 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFIP05156 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFIP05156 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFIP05156 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFIP05156 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFIP05156 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFIP05156 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFIP05156 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFIP05156 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFIP05156 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFIP05156 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFIP05156 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFIP05156 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFIP05156 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFIP05156 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFIP05156 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFIP05156 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFIP05156 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFIP05156 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFIP05156 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFIP05156 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFIP05156 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFIP05156 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFIP05156 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFIP05156 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFIP05156 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFIP05156 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFIP05156 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFIP05156 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CFIP05156 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFIP05156 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFIP05156 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFIP05156 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFIP05156 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFIP05156 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFIP05156 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFIP05156 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFIP05156 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFIP05156 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CFIP05156 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFIP05156 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFIP05156 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CFIP05156 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFIP05156 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFIP05156 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFIP05156 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFIP05156 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFIP05156 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms