Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OPN1SWP03999 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN1SWP03999 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1SWP03999 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN1SWP03999 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms