Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-9P01782 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-9P01782 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms