Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA2P01563 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNA2P01563 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms