Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTLL1O95922 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTLL1O95922 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTLL1O95922 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL1O95922 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TTLL1O95922 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTLL1O95922 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms