Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX4O95219 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX4O95219 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX4O95219 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX4O95219 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX4O95219 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX4O95219 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX4O95219 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX4O95219 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX4O95219 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX4O95219 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX4O95219 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX4O95219 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX4O95219 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX4O95219 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX4O95219 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX4O95219 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX4O95219 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX4O95219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX4O95219 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX4O95219 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX4O95219 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX4O95219 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX4O95219 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX4O95219 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX4O95219 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX4O95219 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX4O95219 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX4O95219 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX4O95219 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX4O95219 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX4O95219 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX4O95219 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX4O95219 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX4O95219 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX4O95219 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX4O95219 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX4O95219 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX4O95219 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX4O95219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX4O95219 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX4O95219 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX4O95219 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX4O95219 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX4O95219 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX4O95219 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX4O95219 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX4O95219 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX4O95219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX4O95219 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX4O95219 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX4O95219 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX4O95219 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX4O95219 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX4O95219 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX4O95219 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX4O95219 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX4O95219 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX4O95219 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX4O95219 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX4O95219 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX4O95219 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX4O95219 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX4O95219 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX4O95219 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX4O95219 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX4O95219 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX4O95219 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX4O95219 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX4O95219 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX4O95219 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX4O95219 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX4O95219 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX4O95219 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX4O95219 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1339.7 ms