Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAMP5O95183 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP5O95183 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAMP5O95183 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms