Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF6O94906 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF6O94906 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF6O94906 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF6O94906 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms