Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD17O75943 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD17O75943 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD17O75943 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD17O75943 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD17O75943 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD17O75943 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD17O75943 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD17O75943 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD17O75943 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD17O75943 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD17O75943 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD17O75943 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD17O75943 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD17O75943 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD17O75943 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD17O75943 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD17O75943 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD17O75943 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD17O75943 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD17O75943 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD17O75943 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RAD17O75943 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAD17O75943 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAD17O75943 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAD17O75943 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAD17O75943 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAD17O75943 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAD17O75943 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD17O75943 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD17O75943 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD17O75943 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD17O75943 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD17O75943 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD17O75943 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAD17O75943 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RAD17O75943 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RAD17O75943 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RAD17O75943 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RAD17O75943 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAD17O75943 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAD17O75943 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAD17O75943 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
RAD17O75943 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD17O75943 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD17O75943 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD17O75943 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD17O75943 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD17O75943 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD17O75943 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD17O75943 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAD17O75943 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAD17O75943 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAD17O75943 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAD17O75943 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD17O75943 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD17O75943 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD17O75943 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD17O75943 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD17O75943 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAD17O75943 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAD17O75943 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
RAD17O75943 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RAD17O75943 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD17O75943 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD17O75943 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD17O75943 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD17O75943 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAD17O75943 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAD17O75943 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAD17O75943 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAD17O75943 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAD17O75943 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAD17O75943 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD17O75943 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD17O75943 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD17O75943 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD17O75943 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD17O75943 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD17O75943 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD17O75943 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAD17O75943 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAD17O75943 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RAD17O75943 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD17O75943 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD17O75943 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD17O75943 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD17O75943 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD17O75943 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD17O75943 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD17O75943 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD17O75943 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD17O75943 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD17O75943 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD17O75943 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD17O75943 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RAD17O75943 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RAD17O75943 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RAD17O75943 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RAD17O75943 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms