Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA10O75578 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA10O75578 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms