Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JRKO75564 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JRKO75564 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JRKO75564 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
JRKO75564 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JRKO75564 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JRKO75564 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JRKO75564 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
JRKO75564 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JRKO75564 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JRKO75564 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JRKO75564 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
JRKO75564 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
JRKO75564 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
JRKO75564 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JRKO75564 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
JRKO75564 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JRKO75564 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JRKO75564 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JRKO75564 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JRKO75564 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JRKO75564 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JRKO75564 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JRKO75564 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
JRKO75564 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JRKO75564 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JRKO75564 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JRKO75564 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JRKO75564 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JRKO75564 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JRKO75564 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JRKO75564 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JRKO75564 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
JRKO75564 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
JRKO75564 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
JRKO75564 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
JRKO75564 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
JRKO75564 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JRKO75564 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JRKO75564 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JRKO75564 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JRKO75564 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
JRKO75564 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
JRKO75564 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JRKO75564 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JRKO75564 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JRKO75564 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
JRKO75564 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JRKO75564 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JRKO75564 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JRKO75564 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JRKO75564 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JRKO75564 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKO75564 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKO75564 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKO75564 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKO75564 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKO75564 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKO75564 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKO75564 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKO75564 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKO75564 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKO75564 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKO75564 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKO75564 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKO75564 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKO75564 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKO75564 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKO75564 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKO75564 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKO75564 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKO75564 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKO75564 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKO75564 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKO75564 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKO75564 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKO75564 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms