Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN5O75503 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN5O75503 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN5O75503 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN5O75503 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN5O75503 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN5O75503 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN5O75503 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN5O75503 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN5O75503 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN5O75503 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN5O75503 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN5O75503 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN5O75503 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN5O75503 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN5O75503 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN5O75503 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN5O75503 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN5O75503 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN5O75503 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN5O75503 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN5O75503 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN5O75503 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN5O75503 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN5O75503 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN5O75503 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN5O75503 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN5O75503 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN5O75503 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN5O75503 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN5O75503 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN5O75503 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN5O75503 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN5O75503 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN5O75503 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN5O75503 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN5O75503 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN5O75503 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN5O75503 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN5O75503 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN5O75503 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN5O75503 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN5O75503 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN5O75503 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN5O75503 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN5O75503 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN5O75503 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN5O75503 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN5O75503 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN5O75503 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN5O75503 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN5O75503 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN5O75503 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN5O75503 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN5O75503 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN5O75503 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN5O75503 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN5O75503 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN5O75503 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN5O75503 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN5O75503 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN5O75503 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN5O75503 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN5O75503 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN5O75503 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN5O75503 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN5O75503 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN5O75503 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN5O75503 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN5O75503 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN5O75503 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN5O75503 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms