Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK1O75385 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK1O75385 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK1O75385 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ULK1O75385 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ULK1O75385 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ULK1O75385 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK1O75385 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK1O75385 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK1O75385 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK1O75385 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK1O75385 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK1O75385 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK1O75385 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK1O75385 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK1O75385 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ULK1O75385 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ULK1O75385 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ULK1O75385 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ULK1O75385 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ULK1O75385 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK1O75385 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK1O75385 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK1O75385 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK1O75385 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK1O75385 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK1O75385 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK1O75385 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ULK1O75385 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ULK1O75385 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ULK1O75385 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK1O75385 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK1O75385 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK1O75385 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK1O75385 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK1O75385 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK1O75385 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK1O75385 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK1O75385 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ULK1O75385 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK1O75385 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK1O75385 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK1O75385 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK1O75385 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ULK1O75385 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ULK1O75385 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ULK1O75385 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ULK1O75385 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ULK1O75385 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ULK1O75385 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ULK1O75385 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ULK1O75385 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ULK1O75385 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ULK1O75385 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ULK1O75385 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK1O75385 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK1O75385 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK1O75385 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK1O75385 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK1O75385 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK1O75385 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK1O75385 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK1O75385 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK1O75385 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK1O75385 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK1O75385 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK1O75385 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK1O75385 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK1O75385 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK1O75385 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK1O75385 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK1O75385 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK1O75385 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK1O75385 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK1O75385 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK1O75385 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK1O75385 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK1O75385 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK1O75385 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK1O75385 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK1O75385 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK1O75385 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK1O75385 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK1O75385 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK1O75385 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms