Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOBOXO60393 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOBOXO60393 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOBOXO60393 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms