Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD5O60279 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD5O60279 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms