Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CYTH3O43739 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYTH3O43739 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYTH3O43739 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYTH3O43739 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms