Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP2O43734 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP2O43734 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms