Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OIP5O43482 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OIP5O43482 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OIP5O43482 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OIP5O43482 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OIP5O43482 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OIP5O43482 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OIP5O43482 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OIP5O43482 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OIP5O43482 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OIP5O43482 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OIP5O43482 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OIP5O43482 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OIP5O43482 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OIP5O43482 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OIP5O43482 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OIP5O43482 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OIP5O43482 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OIP5O43482 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OIP5O43482 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OIP5O43482 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OIP5O43482 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OIP5O43482 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OIP5O43482 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OIP5O43482 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OIP5O43482 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OIP5O43482 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OIP5O43482 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OIP5O43482 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OIP5O43482 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OIP5O43482 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OIP5O43482 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OIP5O43482 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OIP5O43482 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OIP5O43482 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OIP5O43482 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OIP5O43482 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OIP5O43482 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OIP5O43482 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OIP5O43482 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OIP5O43482 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OIP5O43482 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OIP5O43482 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OIP5O43482 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OIP5O43482 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OIP5O43482 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OIP5O43482 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OIP5O43482 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OIP5O43482 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OIP5O43482 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OIP5O43482 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OIP5O43482 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OIP5O43482 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OIP5O43482 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OIP5O43482 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OIP5O43482 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OIP5O43482 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OIP5O43482 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OIP5O43482 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OIP5O43482 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OIP5O43482 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OIP5O43482 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OIP5O43482 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OIP5O43482 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OIP5O43482 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OIP5O43482 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OIP5O43482 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OIP5O43482 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OIP5O43482 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OIP5O43482 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OIP5O43482 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OIP5O43482 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OIP5O43482 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OIP5O43482 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OIP5O43482 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OIP5O43482 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OIP5O43482 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OIP5O43482 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OIP5O43482 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OIP5O43482 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OIP5O43482 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OIP5O43482 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms