Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIAH2O43255 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIAH2O43255 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms