Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
FANCAO15360 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
FANCAO15360 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
FANCAO15360 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
FANCAO15360 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
FANCAO15360 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FANCAO15360 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FANCAO15360 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FANCAO15360 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
FANCAO15360 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FANCAO15360 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
FANCAO15360 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
FANCAO15360 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
FANCAO15360 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
FANCAO15360 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
FANCAO15360 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
FANCAO15360 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
FANCAO15360 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FANCAO15360 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FANCAO15360 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FANCAO15360 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
FANCAO15360 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FANCAO15360 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FANCAO15360 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FANCAO15360 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FANCAO15360 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FANCAO15360 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
FANCAO15360 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
FANCAO15360 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
FANCAO15360 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
FANCAO15360 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
FANCAO15360 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FANCAO15360 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FANCAO15360 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FANCAO15360 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FANCAO15360 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FANCAO15360 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FANCAO15360 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
FANCAO15360 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FANCAO15360 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FANCAO15360 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FANCAO15360 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FANCAO15360 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FANCAO15360 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FANCAO15360 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FANCAO15360 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FANCAO15360 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FANCAO15360 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
FANCAO15360 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FANCAO15360 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FANCAO15360 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
FANCAO15360 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
FANCAO15360 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
FANCAO15360 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FANCAO15360 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FANCAO15360 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
FANCAO15360 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
FANCAO15360 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FANCAO15360 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FANCAO15360 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
FANCAO15360 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
FANCAO15360 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
FANCAO15360 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
FANCAO15360 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FANCAO15360 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FANCAO15360 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
FANCAO15360 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
FANCAO15360 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FANCAO15360 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FANCAO15360 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FANCAO15360 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FANCAO15360 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
FANCAO15360 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
FANCAO15360 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
FANCAO15360 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FANCAO15360 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FANCAO15360 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FANCAO15360 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
FANCAO15360 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
FANCAO15360 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
FANCAO15360 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
FANCAO15360 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
FANCAO15360 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
FANCAO15360 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FANCAO15360 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FANCAO15360 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FANCAO15360 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FANCAO15360 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FANCAO15360 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FANCAO15360 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
FANCAO15360 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FANCAO15360 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
FANCAO15360 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FANCAO15360 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FANCAO15360 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
FANCAO15360 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
FANCAO15360 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
FANCAO15360 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
FANCAO15360 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
FANCAO15360 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms