Protein–RNA interactions for Protein: O15145

ARPC3, Actin-related protein 2/3 complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC3O15145 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC3O15145 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARPC3O15145 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARPC3O15145 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms