Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD2O14939 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD2O14939 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD2O14939 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD2O14939 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD2O14939 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD2O14939 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD2O14939 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD2O14939 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD2O14939 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD2O14939 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD2O14939 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD2O14939 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD2O14939 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD2O14939 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD2O14939 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD2O14939 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD2O14939 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD2O14939 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD2O14939 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD2O14939 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD2O14939 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD2O14939 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD2O14939 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD2O14939 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD2O14939 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD2O14939 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD2O14939 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD2O14939 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD2O14939 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD2O14939 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD2O14939 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD2O14939 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD2O14939 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD2O14939 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD2O14939 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD2O14939 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD2O14939 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD2O14939 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD2O14939 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD2O14939 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD2O14939 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD2O14939 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD2O14939 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD2O14939 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD2O14939 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD2O14939 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD2O14939 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD2O14939 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD2O14939 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLD2O14939 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLD2O14939 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLD2O14939 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLD2O14939 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD2O14939 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD2O14939 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD2O14939 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD2O14939 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLD2O14939 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLD2O14939 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLD2O14939 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLD2O14939 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLD2O14939 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD2O14939 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD2O14939 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD2O14939 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD2O14939 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD2O14939 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD2O14939 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLD2O14939 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLD2O14939 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD2O14939 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLD2O14939 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLD2O14939 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD2O14939 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD2O14939 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD2O14939 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD2O14939 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD2O14939 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD2O14939 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLD2O14939 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLD2O14939 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms