Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXLO00592 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXLO00592 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXLO00592 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXLO00592 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXLO00592 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PODXLO00592 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXLO00592 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXLO00592 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXLO00592 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PODXLO00592 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXLO00592 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXLO00592 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXLO00592 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXLO00592 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXLO00592 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PODXLO00592 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXLO00592 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXLO00592 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXLO00592 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXLO00592 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXLO00592 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXLO00592 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PODXLO00592 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXLO00592 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PODXLO00592 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PODXLO00592 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXLO00592 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXLO00592 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXLO00592 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXLO00592 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PODXLO00592 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXLO00592 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PODXLO00592 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXLO00592 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXLO00592 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PODXLO00592 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXLO00592 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXLO00592 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXLO00592 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PODXLO00592 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PODXLO00592 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXLO00592 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXLO00592 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXLO00592 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXLO00592 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PODXLO00592 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PODXLO00592 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PODXLO00592 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXLO00592 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXLO00592 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PODXLO00592 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PODXLO00592 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXLO00592 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXLO00592 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PODXLO00592 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXLO00592 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXLO00592 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXLO00592 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXLO00592 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PODXLO00592 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PODXLO00592 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PODXLO00592 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PODXLO00592 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PODXLO00592 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXLO00592 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXLO00592 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PODXLO00592 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PODXLO00592 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PODXLO00592 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PODXLO00592 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXLO00592 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXLO00592 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXLO00592 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXLO00592 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXLO00592 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXLO00592 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXLO00592 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXLO00592 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXLO00592 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXLO00592 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXLO00592 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXLO00592 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXLO00592 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXLO00592 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXLO00592 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXLO00592 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXLO00592 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXLO00592 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXLO00592 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXLO00592 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms