Protein–RNA interactions for Protein: O00444

PLK4, Serine/threonine-protein kinase PLK4, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLK4O00444 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLK4O00444 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLK4O00444 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLK4O00444 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLK4O00444 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLK4O00444 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLK4O00444 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLK4O00444 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLK4O00444 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLK4O00444 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLK4O00444 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLK4O00444 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLK4O00444 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLK4O00444 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLK4O00444 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLK4O00444 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLK4O00444 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLK4O00444 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PLK4O00444 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLK4O00444 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLK4O00444 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLK4O00444 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLK4O00444 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLK4O00444 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLK4O00444 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLK4O00444 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLK4O00444 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLK4O00444 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLK4O00444 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLK4O00444 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLK4O00444 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLK4O00444 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLK4O00444 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLK4O00444 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLK4O00444 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLK4O00444 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLK4O00444 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLK4O00444 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLK4O00444 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLK4O00444 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLK4O00444 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLK4O00444 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLK4O00444 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLK4O00444 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLK4O00444 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLK4O00444 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLK4O00444 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLK4O00444 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLK4O00444 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLK4O00444 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLK4O00444 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLK4O00444 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLK4O00444 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLK4O00444 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLK4O00444 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLK4O00444 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLK4O00444 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLK4O00444 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLK4O00444 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLK4O00444 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLK4O00444 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLK4O00444 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLK4O00444 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLK4O00444 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLK4O00444 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLK4O00444 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLK4O00444 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLK4O00444 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLK4O00444 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLK4O00444 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLK4O00444 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLK4O00444 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PLK4O00444 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLK4O00444 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLK4O00444 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLK4O00444 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLK4O00444 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLK4O00444 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLK4O00444 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLK4O00444 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLK4O00444 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLK4O00444 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLK4O00444 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLK4O00444 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLK4O00444 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms