Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC7O00311 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC7O00311 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC7O00311 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC7O00311 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC7O00311 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC7O00311 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC7O00311 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC7O00311 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC7O00311 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC7O00311 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC7O00311 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC7O00311 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC7O00311 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC7O00311 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC7O00311 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC7O00311 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC7O00311 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC7O00311 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC7O00311 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC7O00311 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC7O00311 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC7O00311 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC7O00311 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC7O00311 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC7O00311 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC7O00311 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC7O00311 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC7O00311 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC7O00311 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC7O00311 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC7O00311 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC7O00311 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC7O00311 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC7O00311 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC7O00311 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC7O00311 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC7O00311 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC7O00311 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC7O00311 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC7O00311 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC7O00311 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC7O00311 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC7O00311 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC7O00311 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC7O00311 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC7O00311 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC7O00311 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC7O00311 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC7O00311 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC7O00311 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC7O00311 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC7O00311 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC7O00311 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC7O00311 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC7O00311 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC7O00311 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC7O00311 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC7O00311 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC7O00311 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC7O00311 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC7O00311 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC7O00311 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC7O00311 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC7O00311 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC7O00311 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC7O00311 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC7O00311 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC7O00311 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC7O00311 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC7O00311 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC7O00311 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC7O00311 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC7O00311 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC7O00311 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC7O00311 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC7O00311 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms