Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX16-NPEPL1H3BU86 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX16-NPEPL1H3BU86 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX16-NPEPL1H3BU86 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
STX16-NPEPL1H3BU86 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms