Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BRB1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BRB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BRB1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BRB1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BRB1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BRB1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BRB1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BRB1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BRB1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BRB1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BRB1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BRB1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BRB1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H3BRB1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H3BRB1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H3BRB1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H3BRB1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BRB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BRB1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BRB1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BRB1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BRB1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BRB1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BRB1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BRB1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BRB1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BRB1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BRB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BRB1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BRB1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BRB1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BRB1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BRB1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BRB1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BRB1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BRB1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BRB1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BRB1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BRB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BRB1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BRB1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BRB1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BRB1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BRB1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BRB1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BRB1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BRB1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BRB1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BRB1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BRB1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BRB1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BRB1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BRB1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BRB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BRB1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BRB1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BRB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BRB1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BRB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BRB1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BRB1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BRB1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BRB1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BRB1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BRB1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BRB1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BRB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BRB1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BRB1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28■■■□□ 2.07
H3BRB1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BRB1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BRB1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
H3BRB1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BRB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BRB1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BRB1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BRB1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BRB1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BRB1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BRB1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BRB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BRB1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BRB1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BRB1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BRB1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BRB1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BRB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BRB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BRB1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BRB1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BRB1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BRB1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BRB1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BRB1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BRB1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BRB1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BRB1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BRB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BRB1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms