Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM25AB3EWG3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM25AB3EWG3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM25AB3EWG3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM25AB3EWG3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms