Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM2BA6NLU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM2BA6NLU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM2BA6NLU5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms